일러스트레이터와 포토샵

처음 포샵에서 이모티콘작업을 했는데 그림이 깨져서 지저분한것같아 다시 일러스트레이터에서 이모티콘을 드로잉해서 포토샵으로 파일을 옮겼습니다. 그래서 이전 포샵에서 작업했던 것보다는 깨끗한 것 같은데 그래도 부분 깨지는 것들이 있어서 맘에 들지 않아 고민중에 있었는데 선생님께서 추천해주시는 애니메이터를 보니 포샵보다 더 장점이 많은 것 같아서 이 프로그램을 이용해보려고 합니다.

그런데 일러스트레이터에서 그림을 붓으로 그리기를 했는데 색칠을 하면 어떤 부분은 되고 어떤 부분은 반만 칠해지는데 방법 좀 가르쳐주세요!  제 나름대로 시도해봤는데 도형이 아니라서 색이 안들어가는 것같아  ctrl+J로 선 잇기를 하니까 색이 들어가더라구요 그런데 손가락이나 정교한 부분은 선 합치기가 쉽지 않아서 포샵에 옮겨 일일이 색칠을 했어요 반면에 그림은 픽셀이다보니 깨지는 부분이 있어서 어떻게 해야될지를 모르겠어요

일러스트레이터에서 색칠만 자연스럽게 되면 애니메이터에서 작업하는게 최상인것같아요

답변부탁드립니다.